카자흐스탄에 위치한 어느 산에 UFO추종자들이 모인다. 그러나 그 현장은 곧 엄청난 화재가 남긴 잔재와 불에 탄 시체들로 가득하게 된다. 이 사건을 수사하던 스컬리는 어느 날, 자기도 모르는 힘에 이끌려 버지니아의 한 시골에 위치한 다리에서 열리는 집회에 참가한다. 이것 역시 엄청난 재앙으로 끝이 나지만, 멀더는 이 사건이 외계인들에 의한 대량 살상사건일 것이라는 사람들의 말을 믿지 않는다.
한편, 버지니아 현장에서 살아남은 스컬리는 그 당시에 대한 기억을 전혀 하지 못하고, 멀더의 도움으로 최면상태로 들어가 이 엄청난 사건을 기억해 낸다. 그녀는 이 대량 살상사건이 인류를 위협하는 외계인간의 전쟁이라는 확신을 갖게 되는데….