몇년 후 빌리와 케이트는 뉴욕의 맨하탄으로 와서 거대한 사업체를 운영하는 다니엘 클렘 소유의 최첨단 하이테크 건물인 클렘타워에서 빌리는 일러스트로 케이트는 안내원으로 일하고 있다. 유전자연구소에 TV스튜디오까지 있는 그 건물에서 우연히 기즈모를 발견한 빌리는 기즈모를 구하여 서랍속에 감추지만 청소부의 실수로 그만 물에 닿고만 기즈모는 그렘린들로 변해서 온 건물을 휘젓고 다닌다.
더구나 유전자연구소에서 갖가지 유전자들을 먹고 거미 그렘린, 브레인 그렘린, 섹시 그렘린, 배트맨 그렘린, 전기 그렘린 등 총천연색 개성을 지닌 그렘린들을 대항하여 빌리, 케이트, 기즈모는 고군분투하는데. 마침내 람보 기즈모가 등장하여…