어느날 이집트 사막 한 가운데서 신비한 원형의 유물이 발견된다. 그후로부터 수십년 후, 미 공군은 학계의 진보적인 학자인 다니엘 잭슨을 연구에 투입시킨다. 다니엘은 이 고대유물이 우주로 통하는 출입구라는 것을 알아낸다. 스타게이트에 새겨진 7개문자의 암호를 알아낸 다니엘과 잭 오닐 대령, 그 부하들은 스타게이트의 비밀을 밝히기 위해 스타게이트를 통과하고, 지구로부터 수백만 광년 떨어진 은하계의 한 혹성에 표류한다.
그들이 도착한 곳은 고대 이집트와 같은 모습을 지닌 곳으로 외계의 수수께끼 같은 지도자인 “라”가 지배한다. 그는 지구의 고대 이집트 문명을 건설한 외계인으로 고대 이집트인들을 이 혹성에 끌어다가 노예로 부리고 있었다. 스타게이트를 통과하여 자신의 영역에 침입한 다니엘 일행을 붙잡은 그는 잭 오닐 대령이 자신의 세계를 파괴하러 온 것임을 알고 오히려 지구의 문명을 파괴하려 한다. 외계의 지도자로부터 탈출한 잭슨과 다니엘은 외계의 지배자로부터 지구를 구하기 위해 절대절명의 싸움을 벌여야만 한다.