남극의 거대한 빙산 조각에 억만 년 전에 실종된 아기공룡 둘리가 갇혀 있다가 어느 날 한강으로 흘러 들어오게 된다. 가사 상태에서 깨어난 둘리는 소시민 고길동씨 댁에 머물게 되는데, 호기심 많고 말썽꾸러기인 둘리로 인해 고길동씨 집은 하루도 맘 편할 날이 없다. 거기에 회동이, 회계인 도우너, 또치, 마이콜 등이 가세하고 이들은 타임 코스모스를 타고 빨리어른이 되기 이해 미래 여행을 떠난다. 그러나 타임 코스모스의 작동실수로 이들은 우주의 미로 속에 던져지게 된다.
