버지니아주의 한 정신병원. 외계인의 환영에 시달리고 있는 전직 FBI 듀안 배리가 정신과 의사를 인질로 하여 병원을 탈출한다. 시내로 잠입한 그는 정신병원 의사와 여행사 직원들을 인질로 삼은채 자신이 외계인에게 납치되었던 장소로 돌아가야 한다고 주장하며 소동을 피운다. 이때 인질사건에 투입된 멀더가 응급처리반으로 가장하여 듀안을 만나게 되고 그의 주장에 동조하여 인질들을 석방시킨다.
한편 듀안의 정신과 병명을 밝혀낸 스컬리는 그가 정신분열증세가 심각한 위험인물이라고 알려주지만 멀더는 이에 개의치 않는다. 그러나 멀더의 생명을 위협하던 듀안은 경찰의 총을 맞아 병원으로 이송된다. 그날 밤 갑자기 외계인의 환영에 사로잡힌 듀안. 병원을 다시 탈출하여 스컬리의 집에 침입하는데…