오레곤의 작은 마을에 원인을 알 수 없는 사건이 발생한다. 마을의 경관이 실종되고, 숲속에서는 불을 자유자재로 다스려 사람의 목숨을 빼앗아 가는 괴생명체가 출현한다는 소식을 듣고 멀더와 스컬리는 오레곤으로 급파된다. 한편 튜니지아의 한 수용소에서 구출된 알렉스 크라이첵(Nicholas Lea:니콜라스 레아 분)은 스모킹맨(William B.Davis:윌리암 B. 데이비스 분)과 재회하고, 그와 함게 멀더를 또다시 감시하게 된다.
실종된 남편을 찾고 있는 트리사(Sarah Koskoff:사라 코스코프 분)는 7년전 멀더에게 도움을 요청했던 인연으로 사건의 자초지종을 자세히 설명해준다. 설명을 들은 멀더는 외계생명체의 소행이라고 단정하고 사건이 일어났던 숲속을 조사한다. 조사중 스컬리는 현장에서 알 수 없는 힘에 의해 쓰러졌다가 깨어나지만 다시 의식을 잃는다.
멀더는 혼자서 숲속에 돌아가 조사를 하는중 이상한 힘에 이끌리고 죽은이들의 환영을 본다. 그속에서 그들에게 다가가 외계비행물체에 승선하게 된 멀더. 스키너는 멀더를 찾으로 갔다가 그 모습을 지켜본다. 깨어난 스컬리는 워싱턴으로 돌아가 사건의 해결책을 강구하고, FBI는 멀더의 사무실을 폐쇄한 채 새로운 요원 존에게 사건을 전임시킨다. 스컬리는 꿈속에서 계속 멀더의 환영을 보게되고 그에게 무슨일이 있음을 직감한다.
한편, 새로 부임한 존(Bruce Harwood:브루스 하우드 분)은 스컬리의 이야기를 믿지 않고 결국 스컬리와 함께 직접 오레곤으로 가 사건을 조사하는데…..